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组织结构的差异 矮化砧或短枝型品种，根系皮层发达，而木质部细小，导管少而细，皮层与木质部的比率（根皮率）明显增大。同时木质部组织射线和薄壁细胞等活组织的含量较高，韧皮部中的筛管小且少。矮化砧根系的根毛粗而短，吸收能力较低。这些组织构造上的差异，一方面影响了根系吸收的水分和无机盐类向地上部的供应，限制地上部的生长；另一方面影响地上部光合产物向根系输送，限制了根系生长和吸收功能，又反过来影响地上部的生长。
光能利用率的差异 矮化果树，特别是利用矮化砧的矮化树，叶片较厚，栅栏组织发达，单位叶面积内的叶绿素较多，净二氧化碳吸收率高，光合作用较强，单位面积所具有的相同重量的叶片所积累的光合产物，明显高于乔砧树，而呼吸和蒸腾强度低于乔砧树，因而有利于营养物质的积累，有利于花芽分化，并获得早产高产。 树体营养分配上的差异 矮砧苹果树生长季内树体营养水平与晚秋的贮藏营养水平，显著高于乔砧稀植苹果树。矮砧苹果树的氨态氮、糖、淀粉、钾含量均高于稀植苹果树，所以有利于花芽的形成。 矮砧果树光合产物较少消耗于枝干营养生长。从树体内干物质分配情况来看，乔砧稀植果树果实和枝干中分配的干物质大体相等；而矮砧密植果树，果实中干物质量比枝干中干物质量多5倍以上。这说明矮砧密植果树光合作用形成的同化物质，大量输送于果实生长，消耗于枝干营养生长较少，所以矮化密植树生产效率比乔化稀植树高。 生长抑制物质含量的差异 嫁接在矮化砧木上的品种，其脱落酸的含量较高，而赤霉素的含量较低，并且矮化砧中脱落酸的含量与矮化程度呈正相关，极矮化砧、矮化砧和半矮化砧苹果树脱落酸的含量分别为乔化砧的5倍、3倍和2倍。脱落酸是生长抑制物质，能抑制细胞分裂和伸长，从而抑制枝梢的生长和根的分根，使树体矮化。 相关酶含量及活性的差异 与果树矮化性状密切相关的酶是吲哚乙酸氧化酶和过氧化物酶及其同工酶。吲哚乙酸氧化酶的作用是将吲哚乙酸氧化，使其失去生理功能，抑制树体的生长。有人认为矮化砧的枝皮具有分解吲哚乙酸的能力，从而减少了地上部向下运输吲哚乙酸而导致树体矮化。过氧化物酶也是一种与生长相关的酶，高水平的过氧化物酶也可将吲哚乙酸氧化，同时加速木质化进程，使细胞停长，由此使树体表现矮化。因此，过氧化物酶的活性可以作为矮化苗木的预选指标。 |
